PPIST17785

Protein Information
Protein_Chain A[auth B]
Protein_Sequence MSLVNRKQLEKMANVRFRVQEDEYVAILDALEEYHNMSENTVVEKYLKLKDINSLTDTYIDTYKKSGRNKALKKFKEYLVTEILELKNSNLTPVEKNLHFIWIGGQINDTAINYINQWKDVNSDYNVNVFYDSNAFLINTLKKTIIESASNDTLESFRENLNDPEFNHTAFFRKRMQIIYDKQQNFINYYKAQKEENPDLIIDDIVKTYLSNEYSKDIDELNAYIEESLNKVTENSGNDVRNFEEFKTGEVFNLYEQELVERWNLAGASDILRVAILKNIGGVYLDVDMLPGIHPDLFKDINKPDSVKTAVDWEEMQLEAIMKYKEYIPEYTSKHFDTLDEEVQSSFESVLASKSDKSEIFLPLGDIEVSPLEVKVAFAKGSIINQALISAKDSYCSDLLIKQIQNRYKILNDTLGPIISQGNDFNTTMNNFGESLGAIANEENISFIAKIGSYLRVGFYPEANTTITLSGPTIYAGAYKDLLTFKEMSIDTSILSSELRNFEFPKVNISQATEQEKNSLWQFNEERAKIQFEEYKKNYFEGALGEDDNLDFSQNTVTDKEYLLEKISSSTKSSERGYVHYIVQLQGDKISYEAACNLFAKNPYDSILFQKNIEDSEVAYYYNPTDSEIQEIDKYRIPDRISDRPKIKLTLIGHGKAEFNTDIFAGLDVDSLSSEIETIIDLAKADISPKSIEINLLGCNMFSYSVNVEETYPGKLLLRVKDKVSELMPSISQDSIIVSANQYEVRINSEGRRELLDHSGEWINKEESIIKDISSKEYISFNPKENKIIVKSKNLPELSTLLQEIRNNSNSSDIELEEKVMLAECEINVISNIETQVVEERIEEAKSLTSDSINYIKNEFKLIESISDALYDLKQQNELEESHFISFEDISKTDEGFSIRFIDKETGESIFVETEKAIFSEYANHITEEISKLKDTIFDTVNGKLVKKVTLDATHEVNTLNAAFFIQSLIGYNSSKESLSNLSVAMKVQVYAQLFSTGLNTITDAAKVVELVSTALDETIDLLPTLSEGLPVIATIIDGVSLGASIKELSETSDPLLRQEIEAKIGIMAVNLTAATTAIITSSLGIASGFSILLVPLAGISAGIPSLVNNELILRAEAKNVVDYFGHISLAESEGAFTLLDDKIMMPQDDLVISEIDFNNNSITLGKCEIWRMEGGSGHTVTDDIDHFFSAPSTTYREPYLSIYDVLDVKKEELDLSKDLMVLPNAPDRIFGWERGWTPGLRSLENDGTKLLDRIRDHYEGQFYWRFFAFIADSVITKLKPRYEDTNIRISLDSNTRSFIVPVITTEYIREKLSYSFYGSGGTYALSLSQYNMNINIELNENDTWVIDVDNVVRDVTIESDKIKKGDLIENILSKLSIEDNKIILDNHEINFSGTLNGGNGFVSLTFSILEGINAVIEVDLLSKSYKVLISGELKTLMANSNSVQQKIDYIGLNSELQKNIPYSFMDDEGKENGFINCFTKEGLFVSELSDVVLIIKVYMDNSKPPFGYYSNDLKDVKVITKDDVIILTGYYLKDDIKISLSFTIQDKNTIKLNGVYLDENGVAEILKFMNKKGSTNTSDSLMSFLESMNIKSIFIKSLKSNAKLILDTNFIISGTTSIGQFEFICDKDNNIQPYFIKFNTLETKYTLYVGNRQNMIVEPNYNLDDSGDISSTVINFSQKYLYGIDSCVNKVIISPNIYTDEINITPVHEANNTYPEVIVLDTNYISEKINININDLSIRYVWSNDGSDFILMSTDEENKVSQVKIRFTNVFKGNTISDKISFNFSDKQDISINKIISTFTPSYYVEGLLNYDLGLISLYNEKFYINNLGMMVSGLVYINDSLYYFKPPIKNLITGFTTIGDDKYYFNPDNGGAASVGETIIDGKNYYFSQNGVLQTGVFSTEDGFKYFAPADTLDENLEGEAIDFTGKLIIDENVYYFGDNYRAAIEWQTLDDEVYYFSTDTGRAFKGLNQIGDDKFYFNSDGIMQKGFVNINDKTFYFDDSGVMKSGYTEIDGKYFYFAENGEMQIGVFNTADGFKYFAHHDEDLGNEEGEALSYSGILNFNNKIYYFDDSFTAVVGWKDLEDGSKYYFDENTAEASIGISIINDGKYYFNDSGIMQIGFVTINNEVFYFSDSGIVESGMQNIDDNYFYISENGLVQIGVFDTSDGYKYFAPANTVNDNIYGQAVEYSGLVRVNEDVYSFGESYTIETGWIYDSENESDKYYFDPETKKAYKGINVIDDIKYYFDENGIMRTGLITFEDNHYYFNEDGEMQYGYLNIEDKMFYFSEDGIMQIGVFNTPDGFKYFAHQNTLDENFEGESINYTGWLDLDEKRYYFTDEYIAATGSVIIDGEEYYFDPDTAQLVISEHHHHHHHH
Peptide Information
Peptide_Chain B[auth A]
Peptide_Sequence NEEEKFKFFVWFLAIRAGVPEVEVRNDNGKFQVTVKGDTDAARLLTKEVKEVATFLGVDVDLQIR
Peptide_Length 65
Non-standard residues No
Interaction Information
PDB_ID 8Y9C
Method ELECTRON MICROSCOPY
Resolution 3.00 angstrom
Structure
Protein-peptide residue interaction
Residues
Acidic
Polar
Basic
Aliphatic
Aromatic
Interactions
HBond
WaterBridge
Hydrophobic
SaltBridge
PiStack
PiCation
Halogen
Metal
Interaction_xlsx Download interaction table (.xlsx)
Reference Information
Title De novo design of mini-protein binders broadly neutralizing Clostridioides difficile toxin B variants.
Release_Year 2024
PMID 39358329
DOI 10.1038/s41467-024-52582-1